灌頂法會主要有前行、正行和後行三大部分。
前行的部分有兩個重點：第一個是去除障礙；第二個是累積福慧資糧。去除障礙又可分為去除「內」的障礙和「外」的障礙兩種。剛剛給大家喝從寶瓶倒出的甘露水，就是去除內的障礙，代表清淨自己的身、語、意的障礙和業障，成為接受灌頂的清淨容器，有資格接受殊勝灌頂的加持。另外，送走一個食子（藏文稱「多瑪」），是去除外在障礙的殊勝方法，在「多瑪」的前面點有一盞燈，代表去除無明，因為有形或無形眾生的障礙， 都源自於他們的無明心，因無明而陷入迷惑之後，產生顛倒惡行。在密法裡，「多瑪」具備材料、唸咒、禪定三種殊勝功德合一的能力，可以配合無形象眾生的習氣，滿足他們的任何需求，因此就不會干擾或障礙善事的進行。
第二個是「累積福慧資糧」。累積福慧資糧的方法中，最殊勝、最珍貴、最實際的就是「發菩提心」。發菩提心的意思是：做任何善事之前，在自己內心升起一個清淨、廣泛的出發點為基礎，出自這樣的動機所做的任何善事，結果將會累積無量無邊的福慧資糧。
調伏眾生的煩惱及迷惑而散亂的心，是佛陀教法的核心，也是釋迦摩尼佛加持眾生的最主要關鍵。煩惱、迷惑、散亂等等，這些負面情況的根本病因是「無明」，為了破除無明，佛教的特殊之處就是直接讓眾生們了解萬物的實際情況：上至天人道下至地獄道，每一個眾生，不論形體大小，本來具有如來藏(佛性)，都有機會可以成佛；但是，因為「無明」，無法認出自己本來具有無限智慧、功德的如來藏，而呈現迷惑，由迷惑心執著二取產生許多貪、嗔、癡、傲慢、忌妒、吝嗇等等煩惱，受煩惱的牽引而表現為語和身體的一切行事，都是在造惡業，自作自受的果報就是在三界輪迴中不斷痛苦、煩惱。諸佛菩薩的無限智慧和慈悲，知道「無明」就是眾生所有痛苦煩惱的根源，本師釋迦摩尼佛為了要調伏眾生因無明顯現的迷惑心，斷除一切痛苦和煩惱的因，所以傳了八萬四千種法門。
今天，大家對釋迦摩尼佛的殊勝教法具備虔誠堅定的信心，抽空前來參加灌頂法會，為獲得釋迦摩尼佛殊勝教法的加持，需要先準備一個正確的清淨容器。正確的清淨容器就是內心具有正確的出發點：為了令遍滿虛空的法界一切眾生們，離開三界輪迴的痛苦，達到究竟成佛，我來此接受殊勝教法的灌頂。在接受灌頂後，盡量要求自己的身、語、意隨時朝正面的方向調整，也就是多累積善事。如此清淨的出發點，就是讓自己的心續獲得諸佛菩薩圓滿智慧加持的來源和基礎。
殊勝的菩提心，一般凡夫眾生的心續中不會與生俱來，所以需要透過練習。練習的重點，首先要觀察自己的起心動念，平常我們的習氣都有貪、嗔、癡、傲慢、忌妒、吝嗇等等的煩惱，應該盡量修正，就算沒有這些強烈的煩惱，但非善、非惡的無記念頭，令我們不停地散亂，自己從不知道出現過多少雜念，這也是一種迷惑心，這樣的迷惑心也是導致三界輪迴的來源。所以，無記的念頭，也要改變為善念。善念就是對三寶及釋迦摩尼佛的珍貴教法，從內心凝聚出正確虔誠的「信心」，對三界輪迴的苦海生起厭離的「出離心」，以及願所有的眾生脫離三界輪迴的苦海，獲得究竟成佛的「菩提心」。
釋迦摩尼佛的教法有八萬四千法門，歸納為十二部經典，略說如下：
十二部經典歸納起來有三藏：
經、律、論三藏的內容是增上戒學、增上定學、增上慧學三學，依眾生因緣根器的不同，有配合小乘根器的有緣眾生修行的方法，也有配合大乘根器的有緣眾生修行的方法，更有配合金剛乘（密宗）根器的有緣眾生修行的方法。
今天所傳的是密宗（殊勝金剛乘）的法門。殊勝的金剛乘密法傳到西藏後，因為時代的變遷，有前譯派和新譯派，今天所受灌頂的傳承屬於前譯派或稱寧瑪(巴)派的傳承。寧瑪巴的傳承有兩種大傳承，第一個是「佛語遠傳」，第二個是「伏藏近傳」，有時還會加上一個「深奧淨相傳」，其實「深奧淨相傳」可歸類於伏藏近傳，今天灌頂的法門屬於伏藏法。伏藏近傳的法門，是蓮師佛陀到西藏的時候，將印度所有的顯、密教法，特別是大圓滿法，完整圓滿的翻譯成藏文而傳入西藏，使雪域成為佛教普遍興盛的國家，蓮師佛陀更為了濁時的眾生們，有緣份直接領受殊勝密法無漏圓滿的內容和加持，就如蓮師佛陀所云：
因此伏藏了以五種意大伏藏正法為首的一百零八大伏藏、七萬二千種有名和無名的小伏藏等無數伏藏正法，並預言伏藏正法的上師、伏藏具緣化機、伏藏法主以及發掘的時間等。依照預言，在不同時代、不同的地方出現伏藏上師，發掘伏藏法，利益無數的有緣化機和眾生們，讓他們得到圓滿的加持而獲得成就，這也是蓮師佛陀無限大慈大悲發願的功德。
這些伏藏上師大部分是蓮師佛陀的化身，以及蓮師佛陀的二十五位大成就弟子的化身，今天所傳的這個法門，就是其中與蓮師佛陀成就平等無二的大弟子卓本且瓊的化身 - 大伏藏上師敦珠法王的岩藏法(伏藏法)。三怙主在敦珠法王的岩藏法中，屬於三根本其中之本尊的法門，一般所稱的「三怙主」灌頂，在伏藏法門裡即是「三種本尊合一」的灌頂，這是我直接從上師怙主處獲得的教法，在這裡傳給大家。
很多人一定有參加灌頂的經驗，也約略知道它的意義，我還是要稍加解釋。「灌頂」兩個字直接翻譯，是授予權利之意，也就是授予接受灌頂者修某特定密法的權利，經過授權後，實修這個傳承密法，會得到共和不共的成就。有時也稱灌頂為「成熟灌頂」，「成熟」的意思是：每一個眾生本來具有如來藏(佛性)，但是自己認不出、不明白，因無明遮蓋而變成迷惑心，透過灌頂的加持，讓自己本具如來藏(佛性) 的功德成熟。
得到成熟灌頂後，要繼之以實修，就像過去的成就者們說：「不修無法成佛」。實修時不可錯亂或隨便，一定要依照傳承的修持儀軌，這時則需要解脫訣竅的講解，清楚明瞭修持儀軌內容中的「生起次第」和「圓滿次第」的意義。獲得了解後，實際修持以培養灌頂時所得到的加持，直到成就本尊的地位。灌頂時所得到的加持就像初一的月亮般；而依照解脫訣竅的講解內容如實實修的過程，就像初一到十四號的月亮一樣；完全證悟自己如來藏圓滿的功德與智慧，成就本尊的地位，也就是成佛，就如十五號的月亮般究竟圓滿。
這種本來具有的功德、智慧，單靠自己的能力沒有辦法成熟甚至圓滿證悟之，就算擁有世間最大的權勢、最高的地位、最佳的名望、最多的財富，也起不了一點作用。只有仰賴釋迦摩尼佛的殊勝教法，和不間斷成就的傳承而來的訣竅，並在訣竅的加持進入我們的心續後，不間斷地實修，最後才能圓滿證悟自己本具的如來藏（佛性）的功德。
所以，有心想接觸密法、學習密法或實修密法，受灌頂是不可或缺的，就像過去的成就者們說：「沒有受灌頂，修密法不會有成就，好比『擠沙不會成油』」。又如依古代傳統方法釀酒或製作優酪乳，一定會放入酵母使之發酵，如果沒有酵母，不僅無法製成，時間久了還會全部腐壞。
如同此理，每個眾生都有機會了解本具如來藏的功德，皆可成佛，但是沒有透過密法的殊勝傳承而來的灌頂加持，就如沒有放酵母無法釀成酒一樣，終究無法獲得成就，如此詳細了解後可知，接受灌頂的重點和可貴。
現在有很多人相信佛法，特別對密法有很大的興趣，例如：當聽到財神灌頂的時候，大部分的人都會心動，而且樂於接受，可是卻不知道財神的真正意義。其實，真正的財神就是自己內心的本質，如果沒有累積福慧資糧，本性的功德不會出現，就算親眼見到財神，可以當面直接溝通，請求賜予財富，但由於自己福德的容器不夠，或許比普通人好一點，可是真正到達手中的還是很有限。從前，有一個人在山洞修財神法，有一天，財神出現在他的面前並說：「今天會給你財富。」這個人心想：從今以後將遠離托缽的日子了，於是很高興地外出作最後一次托缽。
他來到一個富有人家門前，主人正在做麵食的佈施，有很多乞丐排隊等候，他也加入行列中，結果每個人都得到一碗麵。吃完後，回到了山洞，財神再次出現，他向財神不滿地說：「你不是說今天會給我財富嗎？我什麼都沒有拿到。」財神說：「我有給啊！」他又說：「今天，我出去托缽只得到一碗麵，連乞丐都有，你給我的財富到底是什麼？」財神回答說：「雖然每個人都拿到一碗麵，但是只有你的碗裏有一塊肉，那就是我給你的財富啊！」所以，如果自己沒有累積福報，也許財神給的是黃金珠寶，但是福德不足，到達手上的時候可能變成沙土，無法完全如願。
佛教的主要重點是：教導眾生隨時檢視自己的起心動念，內心保持正念並學習正向思考。掌握這個重點，無論做什麼事，隨時都能累積福慧資糧，自然而然，財神的功德會從本性的功德中顯現，因為本性如來藏有長壽的功德、藥師佛的功德、還有智慧和慈悲的功德等等，至於自己有多少受用，端看累積多少福慧資糧，累積得多，本來具有的功德會出現更多；如果沒有累積福慧資糧，就會連自己本來的財產都使用不到。就像一個富有的家庭，後代子孫不知道祖先在家裡藏了很多的金銀珠寶，一直過著窮苦的生活。
有一天發覺後，取出遺忘已久的財寶，變成富有的人，一輩子享用不盡。我們自己內心的財庫擁有諸佛菩薩的功德、智慧、慈悲和加持，但因無明心而沒有發覺，長時間在迷惑中痛苦煩惱，當自己覺醒明白的時候，就是解脫痛苦煩惱的時刻到了。所以，「成熟灌頂」能夠成熟自己無始以來，一秒鐘都未曾離開過自己的本性功德。殊勝法脈傳承而來的灌頂的加持，讓本性的功德成熟；解脫的訣竅講解，幫助我們培養直到圓滿。在這過程中，要依靠個人的努力和福報來累積福慧資糧。
上根器或者很努力的人，今生可以證得解脫，圓滿顯現本性的功德；中根器者，在中陰身的時候可以圓滿；下根器者，可以在下輩子圓滿，不用等到三大阿僧祇劫。這就是密法的特殊、加持的可貴。
以上是接受正行的灌頂前，前行的簡易講解，歸納起來有三個重點：第一個，需要以正確的出發點接受灌頂；第二個，要了解何謂灌頂；第三個，今天接受的教法，如何傳承而來。
今天的灌頂法門，本尊就是三怙主。三怙主是一切諸佛菩薩無量的智慧、慈悲、能力的顯現，其中，
諸佛菩薩的「智慧」所顯現的智慧像，就是 文殊菩薩；
諸佛菩薩的「慈悲」所顯現的智慧像，就是 觀世音菩薩；
諸佛菩薩的「能力」所顯現的智慧像，就是 金剛手菩薩。
有些人認為菩薩尚未成佛，其實菩薩的意義有兩種，一種是道的菩薩：從初地到十地菩薩皆屬之；一種是果的菩薩：在名義上是菩薩，實際上與佛一樣的成就。所以，我們常聽到的八大菩薩，名義上是八位大菩薩，實際上具有與一切諸佛無異的成就，具有圓滿的智慧、圓滿的慈悲、圓滿的能力、圓滿的加持、圓滿的事業。三怙主就是所有的諸佛，為了利益末法時代內心煩惱熾盛的眾生，顯現具有智慧、慈悲、能力三者的智慧相。
眾生煩惱熾盛的緣故，自然影響到外界地、風、火、水、空的不調和，造成許多不正常的障礙和顯像，如颱風、水災、火災……甚至火山爆發，這些外界的現象相對也造成眾生的痛苦煩惱。由於眾生猛烈的煩惱業力，以致造惡業的能力隨之強大，所以龍天護法保護善事的能力變弱，也因為這樣的關係，從天上到地下所引發的許多疾病，連醫生都無法找出原因。為了消弭這些現象，諸佛菩薩顯現智慧、慈悲、能力三者合一的本尊相，以幫助眾生去除這些障礙。
今天，三本尊合一的灌頂，實際上是三位怙主顯現為三本尊：文殊菩薩顯現為大鵬金翅鳥本尊、觀世音菩薩顯現為馬頭明王本尊、大勢至菩薩顯現為金剛手本尊，以去除天上、地上、地下的種種障礙，尤其是能完全消除眾生內心因三毒而生的一切業障、障礙的殊勝法門。
這三種本尊合一功德的灌頂，上師修預備法的部份已經在早上圓滿，現在你們為了接受這個具殊勝功德的灌頂，首先需要獻曼達。獻曼達是供養壇城的意思，為什麼需要獻曼達？就如同前面所講，這是為了圓滿自己的福德資糧和智慧資糧的殊勝方法，當福慧資糧足夠時，你才能圓滿達到灌頂的加持、傳承的加持。我們是佛弟子，隨時都應累積福慧資糧，所以，在受灌頂之前，特別以傳統的方法獻供以累積福慧資糧。
你們手上拿著米，一起唸誦獻曼達文，並結獻曼達手印。手印代表壇城，但是不會結手印不要起煩惱，心裡面只要想著：我今天為了接受這個殊勝的灌頂，所有的諸佛菩薩的法身、化身、報身的壇城，以遍滿虛空的殊勝供品，供養諸佛菩薩、供養灌頂上師，祈請獲得殊勝灌頂的圓滿加持。心裡如此觀想，結果也是一樣。
接下來，為了請求灌頂，要唸誦祈請文。祈請文的內容是：一切壇城的總集即根本上師，為了成熟解脫我們自己的身、語、意，請賜給我們三合一本尊的灌頂。
接著雙手合掌跟著我唸誦以下祈請文，內容是：上師答應賜予你們灌頂。再來唸誦的是前行的部份。第二個累積福慧資糧的方法─就是皈依和發菩提心。在你們前面的虛空中，盡量觀想所有諸佛菩薩的總集即三合一本尊或是三怙主，具有一切諸佛的功德，在祂的前面，我們自己和所有的眾生們皈依三合一本尊，為了所有的眾生們解脫三界輪迴的痛苦，達到究竟成佛，我們接受這個灌頂，而自己也會盡量抽空來實修這個法門。
接下來是特別累積福慧資糧的方法 - 唸誦七支供養文，它的內容是頂禮、供養、懺悔、隨喜、祈請諸佛菩薩的化身不涅槃、請轉法輪、功德迴向。
