一般而言，繼「皈依」及「發菩提心」之後，接著是「金剛薩埵法」，然後才是「獻曼達」； 敦珠法王傳承的新巖藏加行短軌， 則是先有「獻曼達」，然後才是「金剛薩埵法」。先後次序的不同並不會有修持上的差別，以下就依照一般的次序進行講解。

「加行」雖然屬於密法，但是它的內容具足了「小乘」、「大乘」到「金剛乘的最頂級——大圓滿法」的加行。前面已經講完小乘、大乘教法的前行內容， 從金剛薩埵法開始，將進入密法無上密的生起次第和圓滿次第的加行。

「金剛薩埵法」是消業障的殊勝方法。特別當我們進入釋迦牟尼佛陀教法的法門，受「別解脫戒」、「菩薩戒」、「金剛戒」之後，必須持守戒律的清淨而實修， 才能獲得一切“共” 和“不共”的成就，因為，戒律就像教法的命一樣重要！一般的初學者，尤其是身處於現今五濁惡世、末法時代的眾生，內心充滿許多煩惱、雜念， 難免因為不明白、不小心等因素，稍一不慎而失毀戒律的清淨，產生障礙，無法獲得成就。「金剛薩埵法」就是消除這些障礙及業障的最殊勝方法。

金剛薩埵在行菩薩道時曾發願：「只要聽到祂的名字，就能完全消除業障，未達到這樣的能力之前，誓不成佛。」立下宏願之後，不斷累積福慧資糧， 最後圓滿成佛者就是金剛薩埵，所以祂具有消除業障的特別能力。

一般的佛教裡（就顯宗而言），為什麼不曾聽過金剛薩埵本尊或金剛薩埵？其實，八大菩薩中的普賢菩薩就是金剛薩埵。提到菩薩的時候， 大部分人的觀念認為：菩薩的成就、智慧尚未達到如佛陀般圓滿。但實際上菩薩有兩種，一種是「果」的菩薩，另一種是「道」的菩薩。如八大菩薩是「果」的菩薩， 早已成佛，只是示現為菩薩的身份行利他事業。例如文殊菩薩是一切諸佛智慧的顯相；觀世音菩薩是一切諸佛慈悲的顯相；金剛薩埵是一切諸佛能力的顯相； 彌勒菩薩是賢劫千佛中的第五佛等等。由此可知，雖然稱呼上是菩薩，實際上祂的成就和佛沒有差別。「道」的菩薩是成就初地到十地果位， 或者是大乘的資糧道、加行道、見道、修道的菩薩們。

消除業障是金剛薩埵本尊因特別發願而成就的事業能力，我們若能誠心懺悔，向祂祈求消除業障、煩惱，一定能如願！ 但須具備佛陀在《大寶積經大乘十法經》中所云的四種對治力來懺悔，眾生如須彌山般高大、堅固，如海洋般深、廣，如微塵數般眾多的業障，才能完全消除。

這四種對治力是所依對治力、厭患對治力、返迴對治力、現行對治力。

所依對治力

所依對治力有兩種，「外所依對治力」和「內所依對治力」。

「外所依對治力」就是在自身的頂上觀想金剛薩埵本尊，並在本尊的心中觀想咒輪等等，以祂作為懺悔的對象。觀想時，盡量觀想一個清淨無染的智慧像，而不是如照片或唐卡中平面的法相，前面有、後面沒有影像，也不是像銅質、金質、木頭般堅硬的法像，亦不是平凡肉身般的顯像。詳細的觀想內容在實修的時候，會更詳細講解。

「內所依對治力」就是發菩提心：是為了所有的眾生，消除各式各樣的業障、疾病、煩惱、障礙、魔障、習氣障等，並達到如金剛薩埵本尊般的成就而修。

厭患對治力

厭患對治力是懷著真正懺悔的心，對自己無始以來到現在所做的一切惡業，從內心產生很強的懺除悔過之心。雖然我們被業障矇蔽無法知道所造的一切惡業，但是金剛薩埵本尊的盡所有智，對過去、未來、現在三時的一切完全透明無礙。所以，在祂遍知的智慧前，從無始以來到現在所做的惡業應悉皆懺悔。懺悔心的強烈程度，應如誤食毒藥，自己的生命將受危害般的強烈後悔心，以此心態來懺悔，方能完全消除過去所造的業障。

返迴對治力

譬如一顆樹的周圍原本有圍牆保護，當這道圍牆破損時，樹很容易被外來的動物啃食，為了保護這棵樹，必須將圍牆修好。同此理，厭患對治力是消除過去所造惡業的方法，而返迴對治力是保證將來不會再造惡業的方法。也就是說過去所造的惡業經懺悔清淨後，在習氣還沒完全消失前，未來仍有可能會犯同樣的錯。所以，我們必須從內心堅定地發誓：將來絕對不再做任何惡業，過去是因為不小心、不明白前因後果所以犯了錯，現在我已清楚明瞭惡業的可怕，將來絕不再誤食毒藥般再造惡業。這種不再犯的誓言就是「返迴對治力」。沒有返迴對治力，無法杜絕將來再造惡業的習氣；過去所造的業，經由懺悔力消除，但是，斷除將來的習氣則需要有返迴對治力。

現行對治力

現行對治力是唸誦「百字明咒」，一面觀想、一面持咒。觀想金剛薩埵本尊心中的咒輪有甘露降下，自頂輪開始清淨我們全身，完全清淨消除所有的業障、煩惱、疾病、魔障、習氣障等。最後，觀想金剛薩埵本尊化成光溶入自身…。以上就是現行對治力。

四種對治力是完全清淨、消除業障的特別關鍵，具足這四種對治力來懺悔，必能淨除一切障礙。